Die Yamaha YZF-R6S ist technisch und optisch klar von der regulären R6 zu unterscheiden. Sie basiert auf einer älteren R6-Generation, wurde jedoch parallel zu den neueren Modellen weiter angeboten.
Aufgrund der eigenständigen Verkleidung und Geometrie sind für die R6S spezielle Dekorsätze notwendig, die nicht mit den regulären R6-Modellen austauschbar sind.

