Mit der Generation 2003–2005 wurde die YZF-R6 konsequent weiter in Richtung Rennsport entwickelt. Die Verkleidung wurde aerodynamischer, die Linien aggressiver und das Gesamtbild deutlich moderner. Diese Modelle gelten als Brücke zwischen der klassischen R6 und den späteren kompromisslosen Rennversionen.
Dekore für diese Baujahre betonen vor allem die scharfen Kanten und die neu definierten Flächen der Seitenverkleidung.
